La producción acuícola de la UE es extremadamente diversa en términos de especies y de sistemas de producción y esta diversificación está aumentando rápidamente. Esto puede exigir que una vez garantizado un estado adecuado de bienestar y salud para los animales, que se le preste más atención a: la simplificación, la flexibilidad, el análisis de riesgos y la evaluación de la relación costos-beneficio de las medidas implementadas.
Las siguientes recomendaciones son el resultado de la síntesis del trabajo del GT peces y del GT moluscos.